Plataforma de Metabolómica del CEBAS-CSIC
Descripción del Servicio
La Plataforma de Metabolómica es un servicio de investigación en metabolómica creado para ofrecer apoyo científico-técnico a las tres áreas relacionadas (Ciencias Agrarias, Ciencia y Tecnología de los Alimentos, y Recursos Naturales).del CEBAS-CSIC y a otras instituciones públicas o privadas que pretendan abordar estudios de este tipo.
La Plataforma de Metabolómica pretende, además de ofrecer servicio, colaborar de manera activa en el desarrollo de proyectos y experimentos relacionados con la metabolómica que los grupos propongan. Ello significa que la colaboración debe ser lo más estrecha posible a lo largo de todas las fases del proyecto (desde la definición de los objetivos, hasta el procesado e interpretación de los datos) ayudando así a obtener resultados satisfactorios, significativos y útiles a los grupos.
Plataforma Metabolómica de Alimentos Vegetales
Unión Europea. Proyecto cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional
La metabolómica permite analizar una gran cantidad de metabolitos en matrices complejas como biofluidos y tejidos de manera automatizada y relativamente rápida. Este análisis genera un perfil de metabolitos cuya comparación, por medio de técnicas estadísticas multivariantes, permite identificar cambios metabólicos específicos para los distintos fenotipos objeto de estudio. Entre otras cabe destacar las aplicaciones clínicas de la metabolómica, como por ejemplo el descubrimiento de biomarcadores y con ello la diagnosis prematura de ciertas enfermedades; su aplicación al estudio de moléculas candidatas en fase preclínica o el uso de dicha técnica en ensayos sobre eficacia terapéutica.
La reciente instalación de la “Plataforma de Espectrometría de Masas de Ultra Alta Resolución y Resonancia Magnética Nuclear integradas a través de Extracción en Fase Solida en línea (LC-MS_SPE_RMN) (CSIC10-2E-860) - Bruker” cofinanciada con fondos FEDER única a nivel nacional y especialmente diseñada para su uso en metabolómica. Esta plataforma permite realizar la exploración de todos los analitos de bajo peso molecular (metabolitos) presentes en distintos tipos de biofluidos (ej. plasma y/o orina) o en tejidos tanto de humanos como de modelos animales y la elucidación estructural inequívoca de metabolitos capturados selectivamente. Además, la plataforma posee otros equipos de última generación ya presentes en el CEBAS-CSIC, como son el HPLC 1200-DAD-ESI-MSn (HTC Bruker), UPLC-MS-Quadrupolo simple (Agilent), UPLC-Triple Quadrupolo (6460 Agilent) y UPLC-QTOF (6550 Agilent).
El diagrama de trabajo para la investigación en Metabolómica, sea Dirigida o No Dirigida, puede ser llevado a cabo a través de las últimas actualizaciones disponibles de los dos principales software de post-procesado de datos (Mass Profiler Professional-Agilent y Hystar-Bruker) en la Plataforma de Metabolómica del CEBAS-CSIC.
PERSONAL DEL SERVICIO DE METABOLÓMICA |
|||
| Frutos Lisón, Mª Dolores | Contrato PTA | Ext - 445326 | [email protected] |
| Toledo Gil, Rosa | Contratada Proyecto | Ext -445326 | [email protected] |
| Vallejo Mellado, Fernando | Coordinador Científico | Ext - 445374 |
|
| Yuste Jiménez, José E. | Titulado Superior Espec | Ext - 445326 |
|
MUESTRAS ALIMENTARIAS
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
| Vitamina C (Ac. Ascórbico) | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
| Vitamina E y derivados | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Compuestos fenólicos | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
| Taurina | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
| Amigdalina y Prunasina | Identificación y Cuantificación | UPLC-UV-QToF |
| Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Se-(metil)-seleno-L-Cisteina (SeMC) | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Alicina y derivados | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Oleuropeína | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Azúcares y ácidos orgánicos | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Compuestos Orgánicos Volátiles (VOCs) | Identificación y Cuantificación | HS-GC-MS |
EXTRACTOS VEGETALES
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
| Glucosinolatos (Alifáticos/Indólicos) (Consultar) | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
| Compuestos Fenólicos | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
| Vitamina C (Ac. Ascórbico) | Identificación y Cuantificación | HPLC-DAD-ESI-MSn |
| Vitamina E y derivados | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Amigdalina y Prunasina | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Alcaloides (Consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Glicoalcaloides (Consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Hormonas vegetales (IAA, SA, ABA, JA y GA3) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Lactonas Sesquiterpénicas | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Micotoxinas (Consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Polialcoholes (Sorbitol, Galactinol, myo-Inositol) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Azucares, ácidos orgánicos y nucleósidos | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Metabolítos Secundarios (consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Trans-Resveratrol | Identificación y Cuantificación | UPLC-UV-QToF |
| Compuestos Orgánicos Volátiles (VOCs) | Identificación y Cuantificación | HS-GC-MS |
MUESTRAS BIOLÓGICAS (Plasma, Orina, cultivos "in vitro")
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
| Vitamina C (Ac. Ascórbico) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Vitamina B y derivados | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Taurina | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Aminoácidos libres (20 esenciales y 2 derivados) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Prostaglandinas (PGs) Consultar | Identificación y Cuantificación | UPLC-Triple Quadrupolo |
| Micotoxinas (Consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC- QToF |
| Lactulosa/Manitol | Identificación y Cuantificación | UPLC-Triple Quadrupolo |
| Farmacología (Benzodiacepinas, Anfetaminas, Cannabinoides y derivados) | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Eicosanoides (Ac. Grasos Poli-insaturados) Consultar | Identificación y Cuantificación | UPLC-Triple Quadrupolo |
| Aminas Biogénicas (Consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Ácidos Biliares (A consultar) | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Ácidos Grasos de cadena corta (SCFA) | Identificación y Cuantificación | GC-MS |
MUESTRAS DE AGUA (EDAR, RIO, RIEGO)
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
| Contaminación Fármacos Emergentes | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
| Drogas de Abuso | Identificación y Cuantificación | UPLC-QToF |
ANÁLISIS METABOLÓMICO "NO DIRIGIDO" DE MUESTRAS BIOLÓGICAS Y EXTRACTOS VEGETALES
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
| Estudios de Metabolómica “no dirigida” (Consultar) | Extracción de los datos crudos (Cromatogramas LC-MS) | UPLC-QToF (F.Scan y AutoMS/MS) |
ANÁLISIS DE ESPECTROSCOPÍA MEDIANTE 1H-RMN (EXTRACTOS VEGETALES, ALIMENTOS Y MUESTRAS BIOLÓGICAS)
APLICACIONES |
PRINCIPIOS |
EQUIPO EMPLEADO |
| Azúcares | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
| Ácidos Orgánicos | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
| Aminoácidos esenciales y derivados | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
| Nucleótidos y derivados | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
| Polialcoholes (Myo-inositol, Galactitol, Sorbitol, Glicerol) | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
| Metabolitos secundarios (Consultar) | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
| Osmolitos (Betaina, Colina, Sarcosina, EA, DMA) | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
| Lignanos (SDG) | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
| Hesperidina (Análisis del isómero S) | Identificación y Cuantificación (relativa) | AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO |
| TARIFAS DEL SERVICIO DE METABOLÓMICA DEL CEBAS-CSIC | ||||
| PLATAFORMAS ANALÍTICAS | CEBAS | CENTROS CSIC | OOPP | OTROS (EMPRESAS) |
| UPLC-UV-QToF-MS (Agilet 6550 y maXis impact series de Bruker) | 40 | 46.92 | 60 | 120 |
| UPLC-Triple Quadrupolo (Agilent 6460) | 40 | 46.92 | 60 | 120 |
| UPLC-DAD-MS-Quadrupolo simple (Agilent) | 30 | 35.19 | 46 | 100 |
| GC‐MS (GC‐8890 y MSD‐5977B Agilent) + Brazo de Gerstel | 40 | 46.92 | 60 | 120 |
| RMN AVANCE III HD 500 MHz CryoProbe Prodigy BBO (Bruker) | 40 | 46.91 | 65 | 120 |
| UPLC-UV-QToF-MS-SPE-NMR 'On-line' (Bruker) | 60 | 70.38 | 100 | 200 |
- Tarifas por muestra (Precio en euros)
- El precio no incluye la preparación de la muestra
- Precios sin IVA
Imágenes
Enlaces
